Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms