Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms