Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms