Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms