Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms