Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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