Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RTL8BQ17RB0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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