Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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