Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25■■□□□ 1.59
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