Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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