Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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