Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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