Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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RPE65Q16518 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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RPE65Q16518 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RPE65Q16518 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RPE65Q16518 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RPE65Q16518 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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