Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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