Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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