Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms