Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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