Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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