Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRADDQ15628 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRADDQ15628 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRADDQ15628 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRADDQ15628 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRADDQ15628 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRADDQ15628 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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