Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TLR1Q15399 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms