Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms