Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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