Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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