Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms