Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPSQ13938 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms