Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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