Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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