Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BFSP2Q13515 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms