Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms