Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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