Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCOF1Q13428 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TCOF1Q13428 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms