Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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