Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA1Q13330 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA1Q13330 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms