Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms