Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATMQ13315 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATMQ13315 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ATMQ13315 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ATMQ13315 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATMQ13315 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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