Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms