Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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