Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO1EQ12965 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO1EQ12965 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms