Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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