Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCB1Q12824 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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