Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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