Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.01□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 VPS8YAL002W 3825 nt2.01□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 RGA1YOR127W 3024 nt2.01□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 PUT3YKL015W 2940 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 INO80YGL150C 4470 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 MSL1YIR009W 336 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 PEP8YJL053W 1140 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 GMC2YLR445W 567 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 ATX2YOR079C 942 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YOR105WYOR105W 327 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YJL181WYJL181W 1836 nt2□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 SPO13YHR014W 876 nt1.99□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 AIM18YHR198C 966 nt1.99□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 ATP7YKL016C 525 nt1.99□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 DGR1YNL130C-A 147 nt1.99□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YOR333CYOR333C 417 nt1.99□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 COS111YBR203W 2775 nt1.99□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 SPP41YDR464W 4308 nt1.99□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 MNE1YOR350C 1992 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YDL187CYDL187C 330 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 MSS18YPR134W 807 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 RPB5YBR154C 648 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 RUD3YOR216C 1455 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 CRM1YGR218W 3255 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 CDC53YDL132W 2448 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 MPH1YIR002C 2982 nt1.98□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 HNT1YDL125C 477 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 RNR4YGR180C 1038 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YLR031WYLR031W 561 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 AFB1YLR040C 675 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 YLR252WYLR252W 306 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 URA10YMR271C 684 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 LSM7YNL147W 348 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 MET18YIL128W 3099 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 SPC72YAL047C 1869 nt1.97□□□□□ -2.09
SFG1Q12507 NAM7YMR080C 2916 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RTR2YDR066C 591 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 BNA7YDR428C 786 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RPL40AYIL148W 387 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YHC1YLR298C 696 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YML084WYML084W 309 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 CSI1YMR025W 888 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 BFA1YJR053W 1725 nt1.96□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 UTP22YGR090W 3714 nt1.95□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 IPT1YDR072C 1584 nt1.95□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YDL158CYDL158C 309 nt1.95□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RPS24AYER074W 408 nt1.95□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 NOP10YHR072W-A 177 nt1.95□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 PHO80YOL001W 882 nt1.95□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 CAT2YML042W 2013 nt1.95□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 STB4YMR019W 2850 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YDR341CYDR341C 1824 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 UTP13YLR222C 2454 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 SPE1YKL184W 1401 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 GCN4YEL009C 846 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YIL029CYIL029C 429 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YIR020CYIR020C 303 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 SPC1YJR010C-A 285 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 CMS1YLR003C 876 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 MDM32YOR147W 1869 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 NAN1YPL126W 2691 nt1.94□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YDL118WYDL118W 381 nt1.93□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 OCA6YDR067C 675 nt1.93□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 TIM10YHR005C-A 282 nt1.93□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 ICY1YMR195W 384 nt1.93□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 DGK1YOR311C 873 nt1.93□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RTT107YHR154W 3213 nt1.93□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 ELG1YOR144C 2376 nt1.93□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 MGA2YIR033W 3342 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YOR093CYOR093C 4947 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YDL068WYDL068W 330 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YKR051WYKR051W 1257 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RPB11YOL005C 363 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RBL2YOR265W 321 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YPL197CYPL197C 414 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 UBR2YLR024C 5619 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 CHC1YGL206C 4962 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RIC1YLR039C 3171 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 NEO1YIL048W 3456 nt1.92□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 MYO4YAL029C 4416 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 SYH1YPL105C 2550 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 SCH9YHR205W 2475 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RPL37BYDR500C 267 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 TIM8YJR135W-A 264 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YLR271WYLR271W 825 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 GRX8YLR364W 330 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RPS22BYLR367W 393 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 RPS7BYNL096C 573 nt1.91□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 SSQ1YLR369W 1974 nt1.9□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 GRR1YJR090C 3456 nt1.9□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 SIR4YDR227W 4077 nt1.9□□□□□ -2.1
SFG1Q12507 YDR220CYDR220C 294 nt1.9□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.3 ms