Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 TIM18YOR297C 579 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RPS12YOR369C 432 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YPL276WYPL276W 438 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 SUL1YBR294W 2580 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RGC1YPR115W 3252 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 ERG28YER044C 447 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YFL032WYFL032W 321 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 PEX4YGR133W 552 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 MRPL33YMR286W 261 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 HEM4YOR278W 828 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YPR014CYPR014C 330 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YIL080WYIL080W 4722 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 DPB11YJL090C 2295 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 MDM32YOR147W 1869 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 CYR1YJL005W 6081 nt2.71□□□□□ -1.98
HER1Q12276 MMS1YPR164W 4224 nt2.7□□□□□ -1.98
HER1Q12276 APC11YDL008W 498 nt2.7□□□□□ -1.98
HER1Q12276 RPC10YHR143W-A 213 nt2.7□□□□□ -1.98
HER1Q12276 RPL37AYLR185W 267 nt2.7□□□□□ -1.98
HER1Q12276 BIL1YOR304C-A 231 nt2.7□□□□□ -1.98
HER1Q12276 NMA111YNL123W 2994 nt2.69□□□□□ -1.98
HER1Q12276 IRC4YDR540C 540 nt2.69□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YJR023CYJR023C 402 nt2.69□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.69□□□□□ -1.98
HER1Q12276 COX14YML129C 213 nt2.69□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.69□□□□□ -1.98
HER1Q12276 POL3YDL102W 3294 nt2.69□□□□□ -1.98
HER1Q12276 CAF120YNL278W 3183 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 TIF35YDR429C 825 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 RPL39YJL189W 156 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YMR320WYMR320W 306 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YPL238CYPL238C 390 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 MSB2YGR014W 3921 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 SKT5YBL061C 2091 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 STE5YDR103W 2754 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YSW1YBR148W 1830 nt2.68□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YKL111CYKL111C 336 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 PRE8YML092C 753 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YOR225WYOR225W 330 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 LCL1YPL056C 306 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 snR36snR36 182 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 GCV2YMR189W 3105 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 SRO77YBL106C 3033 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 RTT10YPL183C 3042 nt2.67□□□□□ -1.98
HER1Q12276 POM152YMR129W 4014 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 SNF12YNR023W 1701 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 ILS1YBL076C 3219 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 SPG3YDR504C 384 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 AST2YER101C 1293 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YJL202CYJL202C 348 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 SHE2YKL130C 741 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 YKR033CYKR033C 426 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 RPL33AYPL143W 324 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 snR191snR191 274 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 SNX41YDR425W 1878 nt2.66□□□□□ -1.98
HER1Q12276 RPL14BYHL001W 417 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 MSL1YIR009W 336 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 ISU1YPL135W 498 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 TRM2YKR056W 1920 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 NDD1YOR372C 1665 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 ROG1YGL144C 2058 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 RLI1YDR091C 1827 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YBT1YLL048C 4986 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 NAB6YML117W 3405 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 TLC1TLC1 1301 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 TRZ1YKR079C 2517 nt2.65□□□□□ -1.99
HER1Q12276 AXL1YPR122W 3627 nt2.64□□□□□ -1.99
HER1Q12276 RSE1YML049C 4086 nt2.64□□□□□ -1.99
HER1Q12276 GCN4YEL009C 846 nt2.64□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.64□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YLR031WYLR031W 561 nt2.64□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YME2YMR302C 2553 nt2.64□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YOR296WYOR296W 3870 nt2.64□□□□□ -1.99
HER1Q12276 TSA2YDR453C 591 nt2.63□□□□□ -1.99
HER1Q12276 CAJ1YER048C 1176 nt2.63□□□□□ -1.99
HER1Q12276 URM1YIL008W 300 nt2.63□□□□□ -1.99
HER1Q12276 APC2YLR127C 2562 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 ISW1YBR245C 3390 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 TOP2YNL088W 4287 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 Q0032Q0032 291 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YDR209CYDR209C 414 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 PAU14YIL176C 363 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 PAU1YJL223C 363 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 SMA2YML066C 1110 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 PGA1YNL158W 597 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 EGD1YPL037C 474 nt2.62□□□□□ -1.99
HER1Q12276 DBP10YDL031W 2988 nt2.61□□□□□ -1.99
HER1Q12276 NPR3YHL023C 3441 nt2.61□□□□□ -1.99
HER1Q12276 RPL23BYER117W 414 nt2.61□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YFR056CYFR056C 369 nt2.61□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.61□□□□□ -1.99
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