Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMPCAQ10713 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms