Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms