Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD47Q08722 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD47Q08722 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD47Q08722 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD47Q08722 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD47Q08722 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms