Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms