Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms