Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLEQ07864 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLEQ07864 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLEQ07864 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms