Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms